第二章保羅勉勵提摩太當在恩典上剛強、如基督的精兵、得冠冕的競賽者、勞力的農夫（二 3～4）；又當作無愧的工人，按正意（或「正確、正直」）分解真理的道（二 15）；還要自潔、脫離卑賤的事，作貴重的器皿；同那清心禱告主的人追求公義、信、愛、和平（二 20～22）。
A. 作無愧的工人，遠離異端。 (14-18)
- 要常常題醒會眾回想保羅以前的教導 (2：14)
- 保羅對提摩太在「要努力在上帝面前作一個經得起考驗、問心無愧的工人，正確地講解真理的信息。」（15節）保羅勸勉提摩太，身為上帝的工人，要正確地講解真理，不該傳講錯誤的信息。
- 警告虛假的教導的危險及基督復活的重要 (2：14-18)
信仰的根基應該是建立在上帝差遣耶穌基督來到世上，透過在十字架上的死，從死裡復活，讓人得著新生命。
B. 許米乃和腓理徒的例子 (2：17-18)
『許米乃』保羅曾提說他的名，將他交給撒但受責罰(參提前一20)；『腓理徒』未見於別處聖經，可能與許米乃同工合作，否定復活的道理(參18節)。指根本就沒有所謂『復活』這回事。這是極其嚴重的異端，因為它否定了來世的盼望(參林前十五52；帖前四16；啟二十4，6)。
C. 神會堅固屬於他的人 (2：19)
我們屬基督的，祂也在我們上面印上石印，表明我們有不改變的信仰。保羅也說我們有聖靈為印記（林後 1：21）印在我們的心裡。當時的房屋通常在根基上刻有主人的記號。教會有神的印記，表示屬祂的證據。